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May 26, 2022 dataset Open access Aachen paper

Bacterial and fungal metabarcoding data characterizing within-canopy and within-leaf microbiota variations of three beech trees (Fagus Sylvatica) and their surrounding environment during the vegetative season of 2017.

Harvard Dataverse

DOI: 10.7910/dvn/ffhaqu Full text (OA) OpenAlex

Abstract

The dataset was created to quantify the magnitude of within-leaf and wihtin-canopy variations in the phyllosphere bacterial and fungal communities in european beech and the impact of such variations on microbial succession during leaf decomposition. The dataset is composed of FASTA files, Amplicon Sequence Variant (ASV) tables, the R code to generate ASV tables from raw sequences and the metadata including description of samples collected (geographic location, dates, trees, canopy and leaf position of the samples).

Authors 6

  1. Tania Fort

    Czech Academy of Sciences · Czech Academy of Sciences, Institute of Microbiology

    Affiliation as printed

    Institute of microbiology of the Czech Academy of Sciences

    (Institute of microbiology of the Czech Academy of Sciences)

  2. Charlie Pauvert Aachen (Uniklinik

    Universitätsklinikum Aachen

    Affiliation as printed

    Uniklinik RWTH Aachen

    (Uniklinik RWTH Aachen)

  3. Émilie Chancerel

    Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

    Affiliation as printed

    Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

    (Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement)

  4. Régis Burlett

    Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

    Affiliation as printed

    Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

    (Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement)

  5. Lisa Wingate

    Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

    Affiliation as printed

    Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

    (Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement)

  6. Corinne Vacher

    Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement

    Affiliation as printed

    Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement

    (Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement)

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